Một trong những thế mạnh của Trường Đại học Ngoại Thương đó là các hoạt động tư vấn quản trị doanh nghiệp được thực hiện thường xuyên bởi Viện Hợp tác nguồn nhân lực Việt Nam Nhật Bản (Viện VJCC) và Viện Kinh tế và Thương mại Quốc tế (IEIT). Hơn 12 khoá đào tạo Quản trị Kinh doanh Cao cấp (Keieijuku) đã được Viện tổ chức trong hơn 10 năm qua bởi chuyên gia từ cả Nhật Bản và Việt Nam. Ngoài ra, Viện còn tổ chức nhiều khoá đào tạo khác về các công cụ quản trị trong đó có nội dung về Monozukuri, quản trị tác nghiệp, áp dụng các công cụ cải tiến Kaizen cho các doanh nghiệp trong ngành công nghiệp hỗ trợ. Nhiều doanh nghiệp đã tham gia các chương trình đào tạo và đã chuyển đổi thành công sang áp dụng những phương thức, công cụ quản lý mới, hiện đại trong đó có công cụ cải tiến Kaizen ví dụ như Công ty Cổ phần Canifa, Công ty Cổ phần xử lý nền và xây dựng Fecon, Công ty TNHH Bê tông Việt Đức, Tập đoàn Hà Yến, Tập đoàn Việt Vương…
Trong năm 2017, Trường Đại học Ngoại Thương đã kết hợp với Hiệp hội Ngành công nghiệp Trung ương Nhật Bản (ChuSanRen) tổ chức một khoá đào tạo chuyên gia tư vấn (Training of Trainer – ToT) về việc áp dụng các công cụ cải tiến Kaizen tập trung vào 5S cho các giảng viên của Nhà trường. Khóa đào tạo đã kết hợp các hoạt động giảng dạy trên lớp với hướng dẫn tư vấn thực tế tại doanh nghiệp. Thông qua khóa đào tạo này, các chuyên gia hàng đầu về tư vấn công cụ cải tiến Kaizen của tổ chức ChuSanRen đã chuyển giao công nghệ tư vấn công cụ cải tiến Kaizen cho các giảng viên của Nhà trường. Từ năm 2017 đến nay, các giảng viên này đã bắt đầu thực hiện tư vấn thay đổi phương thức quản trị và áp dụng 5S cho một số cơ sở sản xuất. Do đó, trường Đại học Ngoại thương đã có sẵn một đội ngũ tư vấn viên có đủ năng lực và kinh nghiệm thực tế để tiến hành đào tạo, tư vấn áp dụng công cụ cải tiến Kaizen cho các cơ sở sản xuất trong các làng nghề ở Việt Nam
Đặc biệt gần đây, Trường Đại học Ngoại thương đã có những nghiên cứu, chương trình bước đầu để thúc đẩy áp dụng phương thức quản trị doanh nghiệp mới, hiện đại, có hệ thống và ở mức độ nhất định áp dụng công cụ cải tiến Kaizen vào các doanh nghiệp ở một số làng nghề. Trường Đại học Ngoại thương đã tổ chức một số buổi tập huấn về quản lý doanh nghiệp kết hợp với nghiên cứu, đánh giá tác động của chương trình tập huấn tới kết quả kinh doanh cho một số ít các cơ sở sản xuất ở một số làng nghề như làng nghề sắt thép Đa Hội, làng nghề dệt kim La Phù và làng nghề chăn ga gối đệm Trát Cầu. Những nghiên cứu bước đầu này đã chỉ ra các làng nghề thiếu nhiều kiến thức, kỹ năng quản lý hiện đại, đồng đều . Kiến thức quản trị doanh nghiệp dù đơn giản như lập kế hoạch kinh doanh, ghi chép sổ sách kế toán, các kỹ năng marketing, quản lý lao động cũng cần được bổ sung. Một số cơ sở khi áp dụng phương thức quản lý sản xuất mới đã đạt được những kết quả khả quan bước đầu ví dụ như doanh thu tăng lên và năng suất cao hơn.